近日,高等研究院李猛教授團(tuán)隊在古菌微生物的生理代謝研究取得了突破性進(jìn)展。研究工作以“Comparative genomic inference suggests mixotrophic lifestyle for Thorarchaeota”為題發(fā)表在微生物學(xué)頂級刊物The ISME Journal(IF=9.664,doi10.1038/s41396-018-0060-x)。李猛教授為通訊作者,課題組成員劉楊副研究員(原李猛教授博士后)為第一作者,深圳大學(xué)為第一完成單位和唯一通訊單位。
古菌作為微生物的一個重要組分,在地球生命演化過程中扮演著極為重要的角色。自從2015年洛基古菌的發(fā)現(xiàn),到2016年的索爾古菌,以及最近Asgard古菌超級門的發(fā)現(xiàn)和建立,這一類在極端和普通環(huán)境下都有所分布的古菌被認(rèn)為是迄今以來,距離真核生物起源最近的一類古菌。基于這一類古菌的基因組和功能代謝預(yù)測研究為理解真核生物的起源與生命之樹的系統(tǒng)發(fā)育開辟了新的研究道路。李猛教授團(tuán)隊與香港大學(xué)生物科學(xué)學(xué)院顧繼東教授、美國德克薩斯大學(xué)奧斯丁分校Brett J. Baker教授合作,采用宏基因組和生物信息學(xué)技術(shù)手段,在深圳灣紅樹林濕地沉積物中獲得了索爾古菌的三個高質(zhì)量基因組草圖。通過基因組的精細(xì)分析發(fā)現(xiàn),索爾古菌具有降解有機(jī)質(zhì)、固定無機(jī)碳、還原硫單質(zhì)或硫酸鹽,以及產(chǎn)乙酸等代謝途徑(圖1)。研究結(jié)果對于認(rèn)識古菌在生態(tài)環(huán)境中的作用以及揭示真核生物起源等方面都有十分重要的意義。
該研究得到了國家自然科學(xué)基金、中國博士后基金、廣東省自然科學(xué)基金和深圳市科創(chuàng)委基礎(chǔ)研究項目及孔雀技術(shù)創(chuàng)新項目等多項基金的支持。
論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41396-018-0060-x
圖:索爾古菌的比較基因組分析