2024年1月10日，

李猛教授為論文通訊作者，深圳大學(xué)-香港科技大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)項(xiàng)目博士研究生段昌海為該論文的第一作者。

深古菌是一類廣泛分布于厭氧沉積物環(huán)境中的微生物。由于其具有高的全球生物量、廣泛的生態(tài)分布及復(fù)雜的碳代謝能力，深古菌在全球碳循環(huán)中可能發(fā)揮著重要作用。然而，病毒對(duì)微生物的生理和生態(tài)功能會(huì)產(chǎn)生重大影響。因此，研究深古菌病毒的多樣性以及其與宿主的相互作用關(guān)系，可以幫助我們更全面地了解深古菌的生態(tài)功能，同時(shí)也為研究宿主與病毒之間的防御機(jī)制提供了基礎(chǔ)。

李猛教授團(tuán)隊(duì)采集了大量公共數(shù)據(jù)庫中以及實(shí)驗(yàn)室特有的深古菌基因組，利用生物信息學(xué)方法，鑒定得到了4類屬于不同科的古菌病毒。通過系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)，這些病毒分屬于兩個(gè)不同的病毒域以及一個(gè)古菌特有的病毒科。為了弘揚(yáng)中國(guó)經(jīng)典文化，該團(tuán)隊(duì)以山海經(jīng)中的神話人物為這些病毒命名，包括伏羲病毒科（Fuxiviridae）、鯤鵬病毒科（Kunpengviridae）、蚩尤病毒科（Chiyouviridae）和黃帝病毒科（Huangdiviridae）。分析還發(fā)現(xiàn)，這些深古菌病毒基因組中含有多個(gè)CRISPR-Cas系統(tǒng)元件的基因，包括編碼一個(gè)特異的Type IV-B CRISPR-Cas系統(tǒng)及cas2和cas4蛋白。此外，研究人員還在病毒基因組中發(fā)現(xiàn)了mini-CRISPR array，為后續(xù)病毒反防御機(jī)制的研究打開了新的思路。

該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2022YFA0912200）、國(guó)家自然科學(xué)基金（32225003、92251306、31970105）、廣東省教育廳創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)（No. 2020KCXTD023）、深圳市科技計(jì)劃（JCYJ20200109105010363）以及深圳大學(xué)2035追求卓越研究計(jì)劃（2022B002）等項(xiàng)目的資助。

論文鏈接：https://doi.org/10.1093/ismeco/ycad011

圖1 深古菌病毒的多樣性及其宿主的防御系統(tǒng)

（來源 深圳大學(xué)高等研究院）